При обновлении базы MySQL на Centos 6 с 5.5 до 5.7 вы можете столкнуться с конфликтом пакетов:

Transaction Check Error:
  file /usr/lib64/mysql/libmysqlclient.so.16.0.0 from install of mysql-community-libs-compat-5.7.11-1.el6.x86_64 conflicts with file from package compat-mysql51-5.1.54-1.el6.remi.x86_64
  file /usr/lib64/mysql/libmysqlclient_r.so.16.0.0 from install of mysql-community-libs-compat-5.7.11-1.el6.x86_64 conflicts with file from package compat-mysql51-5.1.54-1.el6.remi.x86_64

Данная проблема легко решается следующей коммандой:

$ yum shell
> remove compat-mysql51
> install mysql-community-libs-compat
> run

Это позволит обновить необходимый пакет без нарушения зависимостей.